Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXLO00592 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXLO00592 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXLO00592 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXLO00592 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXLO00592 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXLO00592 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXLO00592 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXLO00592 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXLO00592 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXLO00592 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXLO00592 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXLO00592 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXLO00592 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXLO00592 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXLO00592 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXLO00592 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXLO00592 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXLO00592 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXLO00592 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PODXLO00592 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXLO00592 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXLO00592 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXLO00592 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXLO00592 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXLO00592 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXLO00592 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXLO00592 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PODXLO00592 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PODXLO00592 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PODXLO00592 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PODXLO00592 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PODXLO00592 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PODXLO00592 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PODXLO00592 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PODXLO00592 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PODXLO00592 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PODXLO00592 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PODXLO00592 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PODXLO00592 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PODXLO00592 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PODXLO00592 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PODXLO00592 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PODXLO00592 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PODXLO00592 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PODXLO00592 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PODXLO00592 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PODXLO00592 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PODXLO00592 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PODXLO00592 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PODXLO00592 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PODXLO00592 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PODXLO00592 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PODXLO00592 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PODXLO00592 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PODXLO00592 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PODXLO00592 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PODXLO00592 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXLO00592 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXLO00592 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXLO00592 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXLO00592 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXLO00592 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXLO00592 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXLO00592 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXLO00592 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXLO00592 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXLO00592 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXLO00592 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXLO00592 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXLO00592 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXLO00592 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXLO00592 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXLO00592 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXLO00592 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXLO00592 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXLO00592 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms