Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SCO1-204ENST00000579396 563 ntTSL 221.96■■□□□ 1.112e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 GNPTG-206ENST00000527876 550 ntTSL 421.87■■□□□ 1.094e-11■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 KLHDC2-208ENST00000555739 1696 ntTSL 521.49■■□□□ 1.032e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.992e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.968e-9■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.928e-9■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.928e-9■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.92e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SCO1-202ENST00000577335 571 ntTSL 320.32■□□□□ 0.842e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.772e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 PIP4K2C-205ENST00000550095 941 ntTSL 519.8■□□□□ 0.762e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SELENOM-207ENST00000490967 2070 ntTSL 1 (best)18.48■□□□□ 0.552e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SCP2-214ENST00000528809 570 ntTSL 518.1■□□□□ 0.495e-12■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.438e-9■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SELENOM-205ENST00000465536 703 ntTSL 217.65■□□□□ 0.422e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SELENOM-206ENST00000469262 334 ntTSL 217.59■□□□□ 0.412e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.372e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.368e-9■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.352e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.332e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.312e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SELENOM-208ENST00000491958 605 ntTSL 216.51■□□□□ 0.232e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.082e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SELENOM-204ENST00000465447 707 ntTSL 315.53■□□□□ 0.082e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 ATP6V0E2-206ENST00000471877 1766 ntTSL 215.35■□□□□ 0.058e-9■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.018e-9■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 PIP4K2C-206ENST00000550360 608 ntTSL 514.31□□□□□ -0.122e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 PIP4K2C-203ENST00000540759 2876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.292e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.362e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 PIP4K2C-208ENST00000551772 548 ntTSL 412.6□□□□□ -0.392e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 OXCT1-201ENST00000196371 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.572e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 PIP4K2C-201ENST00000354947 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SELENOM-203ENST00000460642 500 ntTSL 311.29□□□□□ -0.62e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 ZNF8-201ENST00000621650 9128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.642e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SCO1-205ENST00000582053 565 ntTSL 49.08□□□□□ -0.962e-16■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.994e-9■■■■■ 38.8
DDX3XO00571 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.794e-9■■■■■ 38.8
DDX3XO00571 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.47e-8■■■■■ 38.8
DDX3XO00571 AC009163.4-202ENST00000561887 137 ntTSL 213.65□□□□□ -0.228e-8■■■■■ 38.8
DDX3XO00571 AC009163.4-203ENST00000566594 254 ntTSL 213.65□□□□□ -0.228e-8■■■■■ 38.8
DDX3XO00571 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.195e-7■■■■■ 38.8
DDX3XO00571 BOLA3-205ENST00000484655 2982 ntTSL 1 (best)20.27■□□□□ 0.838e-12■■■■■ 38.8
DDX3XO00571 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.638e-12■■■■■ 38.8
DDX3XO00571 BOLA3-203ENST00000469676 1436 ntTSL 517.73■□□□□ 0.438e-12■■■■■ 38.8
DDX3XO00571 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.248e-12■■■■■ 38.8
DDX3XO00571 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.356e-9■■■■■ 38.8
DDX3XO00571 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.436e-9■■■■■ 38.8
DDX3XO00571 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.56e-9■■■■■ 38.8
DDX3XO00571 PLEKHA8-204ENST00000440706 7514 ntTSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.971e-21■■■■■ 38.7
DDX3XO00571 NDUFA7-202ENST00000593729 569 ntTSL 216.08■□□□□ 0.162e-18■■■■■ 38.7
DDX3XO00571 NDUFA7-204ENST00000601101 414 ntTSL 415.5■□□□□ 0.072e-18■■■■■ 38.7
DDX3XO00571 NDUFA7-201ENST00000301457 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.432e-18■■■■■ 38.7
DDX3XO00571 NDUFA7-203ENST00000595856 553 ntTSL 510.14□□□□□ -0.792e-18■■■■■ 38.7
DDX3XO00571 TSEN54-209ENST00000583454 733 ntTSL 325.76■■□□□ 1.712e-7■■■■■ 38.7
DDX3XO00571 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.582e-7■■■■■ 38.7
DDX3XO00571 TSEN54-207ENST00000580013 568 ntTSL 422.65■■□□□ 1.222e-7■■■■■ 38.7
DDX3XO00571 TSEN54-208ENST00000583173 798 ntTSL 522.65■■□□□ 1.222e-7■■■■■ 38.7
DDX3XO00571 TSEN54-202ENST00000434205 627 ntTSL 517.05■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 38.7
DDX3XO00571 ANAPC5-222ENST00000545801 1281 ntTSL 213.77□□□□□ -0.217e-37■■■■■ 38.7
DDX3XO00571 ANAPC5-205ENST00000534976 3165 ntTSL 510.93□□□□□ -0.667e-37■■■■■ 38.7
DDX3XO00571 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 GPX3-203ENST00000519214 834 ntTSL 514.36□□□□□ -0.111e-59■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 GPX3-207ENST00000521650 467 ntTSL 213.41□□□□□ -0.261e-59■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.331e-59■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 GPX3-208ENST00000521722 464 ntTSL 312.98□□□□□ -0.331e-59■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.085e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 BCL7C-204ENST00000574418 1206 ntTSL 526.91■■□□□ 1.95e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.855e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 BCL7C-203ENST00000572628 1603 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.245e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 AC135048.2-201ENST00000572471 561 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.865e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 KIAA1551-207ENST00000541981 674 ntTSL 214.45□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 KIAA1551-206ENST00000540924 362 ntTSL 211.83□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 KIAA1551-203ENST00000397578 814 ntTSL 38.16□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 KIAA1551-204ENST00000535596 965 ntTSL 27.55□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.12e-6■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.745e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.645e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 OARD1-206ENST00000467234 422 ntTSL 216.33■□□□□ 0.25e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 OARD1-205ENST00000465893 1456 ntTSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.045e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.035e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.045e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.055e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.215e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 OARD1-210ENST00000479950 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.655e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 OARD1-215ENST00000488238 814 ntTSL 55.89□□□□□ -1.475e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.475e-8■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 38.6
DDX3XO00571 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.933e-31■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.823e-31■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.323e-31■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 213.85□□□□□ -0.193e-31■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-208ENST00000578473 2482 ntTSL 1 (best)23.04■■□□□ 1.289e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.139e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.19e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.079e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-206ENST00000577509 1912 ntTSL 221.63■■□□□ 1.059e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-218ENST00000583881 1561 ntTSL 221.35■■□□□ 1.019e-24■■■■■ 38.5
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