Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-1B6SEH8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms