Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PP2D1A8MPX8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms