Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms