Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNZ2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNZ2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNZ2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNZ2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNZ2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNZ2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNZ2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNZ2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNZ2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNZ2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNZ2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNZ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNZ2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNZ2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNZ2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNZ2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNZ2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNZ2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNZ2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNZ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNZ2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNZ2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNZ2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNZ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNZ2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNZ2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A6NNZ2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A6NNZ2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
A6NNZ2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A6NNZ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNZ2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNZ2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNZ2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNZ2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNZ2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNZ2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNZ2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNZ2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNZ2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNZ2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNZ2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNZ2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNZ2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNZ2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms