Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SAC3D1A6NKF1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SAC3D1A6NKF1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SAC3D1A6NKF1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAC3D1A6NKF1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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