Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZNF316A6NFI3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms