Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRD1A4D1F6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRD1A4D1F6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms