Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM72A0PK05 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM72A0PK05 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms