Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTZ2

CCDC196, Putative coiled-coil domain-containing protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC196A0A1B0GTZ2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC196A0A1B0GTZ2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC196A0A1B0GTZ2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms