Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWB2

TRBV7-9, T-cell receptor beta variable 7-9 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-9A0A0J9YWB2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRBV7-9A0A0J9YWB2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRBV7-9A0A0J9YWB2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRBV7-9A0A0J9YWB2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV7-9A0A0J9YWB2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms