Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQK5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
U3KQK5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQK5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQK5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQK5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQK5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms