Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01558Q9Y6Z2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms