Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN6Q9Y6Q1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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