Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms