Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms