Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms