Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms