Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF5Q9Y2D1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms