Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms