Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVW-1Q9UQF0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms