Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD4AQ9UPU9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms