Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAF8Q9UPN6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms