Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms