Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.39■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
INO80Q9ULG1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms