Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms