Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms