Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms