Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms