Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA2Q9UJY4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms