Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSR3Q9UJK0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms