Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms