Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms