Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPC1L1Q9UHC9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms