Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms