Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms