Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APEX2Q9UBZ4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms