Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPASTQ9UBP0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms