Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RCOR3Q9P2K3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms