Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9Q9P2J2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9Q9P2J2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms