Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
RRBP1Q9P2E9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms