Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM5Q9P217 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM5Q9P217 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms