Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCNT4Q9P109 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCNT4Q9P109 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT4Q9P109 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT4Q9P109 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT4Q9P109 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT4Q9P109 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT4Q9P109 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT4Q9P109 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms