Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms