Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms