Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms