Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms