Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms