Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASF1BQ9NVP2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms